Itäisen kantakaupungin erikoismuseot Diakonissalaitoksen museo, Elävän kuvan museo, Lastentarhamuseo sekä Työväenasuntomuseo ovat avoinna Kallio Kukkii –kaupunkifestivaalin aikana. Helsingin Diakonissalaitoksen museo on muuttanut uuteen paikkaan ja uudistunut samalla täydellisesti. Museo sijaitsee nyt Päärakennuksessa ja sen nimi on Diamus. Museon perusnäyttey on nimeltään "Minä olen, koska sinä olet". Museo tekee samalla opastuksia ennakkovarauksesta näyttelyn lisäksi Aurora-saliin ja kirkkoon sekä Alppikadun kortteliin. Lähellä Kalasataman metroasemaa sijaitsevassa Elävän kuvan museo (Vanha talvitie 9) pidentää Kukkii –viikon aikana aukioloaikojaan sekä näyttää Helsinki-aiheisia lyhytelokuvia. Museon peruskokoelman lisäksi museon näyttelytilassa on Malla Hukkasen valokuvanäyttely ”Valkokankaan sankarit” sekä Felix Forsmanin elokuva-aiheisia veistoksia. Lastentarhamuseo Helsinginkadulla on avoinna keskiviikkoisin. Kallio Kukkii –viikolla museossa näytettään diaesitys lastentarhalasten puutarhanhoidosta. Myös Työväenasuntomuseo Kirstinkujalla avautuu toukokuussa. Sturenkadulla, Kulttuuritalon vieressä, sijaitseva Museoviraston kirjasto juhlii myös 20 vuotta täyttävää Kallio Kukkii –festivaalia. Viraston kirjastossa 15.5. klo 16.30 esiintyy Ville Leinonen. Kirjaston näyttelynä on Johanna Sepän uudelleen muotoiltujen kirjojen näyttely. Museoiden tarkemmat ohjelmat löytyvät Kallio Kukkii ohjelmasta, osoitteesta kallionkulttuuriverkosto.fi/kalliokukkii/ohjelma/. Kallio Kukkii –kaupunkifestivaali alkaa 9.5. ja jatkuu aina sunnuntaihin 18.5. saakka.